在军备建设大有成就后，袁可立正式对后金开战，与驻守皮岛的毛文龙一起，于天启三年七月，一举收复辽东要塞金州卫。随后，袁可立又命勇将张盘等人扩大战果，接连攻克复州、盖州两卫及旅顺、红嘴、望海、永宁等要塞，使得后金四卫已空其三，沿海四百余里之地尽数抛弃。
努尔哈赤为了夺回失地，屡派八旗劲旅进行反扑，然而每一次都被早有防备的袁可立击败。尤其是在当年十月的旅顺保卫战中，大将张盘在登莱总兵沈有容的策应下，于旅顺城下设伏并夜袭后金，使得后者大败亏输，以至于器械、铳炮俱掷弃而逃。次年正月，后金大军再次来袭，结果再次以惨败告终。
袁可立担任登莱巡抚不到三年时间，接连与后金交战七次，竟然都以完胜告终，让努尔哈赤吃尽苦头。当然，袁可立除了在辽东积极收复失地外，还曾取得过一项非凡成就，那便是成功地招降了努尔哈赤的女婿、后金汉人名将刘爱塔，使得后者弃金投明，并为故国捐躯疆场。这件事情成为了后金和后来的大清一直想要掩盖的奇耻大辱。
在袁可立的辛苦经营下，明朝在辽东的形势大为好转，然而就在此时，他却遭到东林党、阉党的交相攻讦，最终心灰意冷，所以连上六十七道辞职信，终于在天启驾崩前获批。
真实的历史上，袁可立去职后，辽东的形势急转直下，收复的据点又相继沦陷。不仅如此，连袁可立精心构筑的登莱防线，也因为“登莱兵变”的缘故而土崩瓦解。崇祯六年（1633年）十月，心力交瘁、万念俱灰的袁可立薨逝于老家河南睢州（后世河南商丘睢县），终年72岁。
正因为袁可立屡屡重创后金，并且还成功地策反刘爱塔，所以清朝对其恨之入骨，并在入关后拼命地抹杀他的事迹，禁毁有关于他的传记和著作，而且在编修《明史》时也拒绝为他立传。清朝的皇帝连一个秀才写出“清风不识字，何故乱翻书”这样的普通诗句，都牵强附会到以为秀才用“清风”讽刺“清朝”而把这个秀才下了大狱，这样对待袁可立就丝毫不稀奇了。
是以很多人都不知道历史上还有这么一个牛人。相反，对于袁崇焕这样的人，崇祯把他给杀了，清朝写的历史上却一直再浓墨重彩的描写袁崇焕的功绩，一直在引导人们以为是杀了袁崇焕才导致大明的灭亡，以此来证明崇祯昏庸杀错了人，误用奸臣。巩永固在后世的时候，知道了袁可立的事迹，去仔细研究了一下这两个人，就发现关于清朝为他俩写的历史，反过来读就可以了。曾经看这样一句话：看国内的新闻要看国外的报纸，看国外的新闻要看国内的报纸。
听完徐光启的介绍，加上他自己的前世记忆，他理解了徐光启的心情，这是对一位功臣命运的悲哀之情，对自己命运的自怜之情，对国家的担忧之情。
念及此处，巩永固哪里还会犹豫，一定得把袁可立拉进自己的阵营里面来。凡是敌人恐惧的就是我们要争取的，凡是敌人反对的就是我们要坚持的。
可是袁可立去意已决，而且花了这么大的功夫才获得皇上的批准，绝不可能因为徐光启或者巩永固的一两句话就会改变主意。你想想，刚批准才不到十天，又出来做官了，会让别人私底下怎么议论，莫不说袁可立心灰意冷，就算他能回心转意，他堂堂的读书人可是非常注重气节颜面的。怎么请袁可立出山这是个难题啊。
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